Rovalan Setlementti ry:n yhdistyksen kokous valitsee yhdistyksen hallituksen. Hallitus valvoo, johtaa ja kehittää Rovalan Setlementin toimintaa sekä päättää yhdistyslaissa ja säännöissä mainituista asioista. Hallitus toimii ylläpitämiensä oppilaitosten, Rovaniemen kansalaisopiston ja Rovala-Opiston johtokuntana.